他为了死亡，选择了侦探之路时为2030年代。集合在神秘侦探明智小五郎手下的少年侦探团。他们以天赋的行动力，将大大小小的事件导向解决。某天，成员花崎健介遇到了神秘的少年小林芳雄。由于正体不明的烟雾而变成无法死去之身的小林，期盼着自身的死，拒绝与他人的接触。对于这样的他的存在怀有兴趣的花崎向他提出要不要加入少年侦探团？小林与花崎。他们的相遇，终将与世纪的犯罪者怪人二十面相和明智小五郎的因缘相互交错，并推动两人的命运